Japonya’da vergiler Anayasaya dayalı olarak, Japon Ulusal Kongresinin (DİET) onayladığı kanunlarla uygulama alanı bulur. Dolaylı ve dolaysız vergiler vergi kanunları nın kanunilik prensibine dayalı olarak merkezi devlet ve mahalli idarelerce alınır. Vergilerin kanuniliği prensibine uygun yetki kullanan Japonlar vergisel uyuşmazlıkları yargıya gitmeksizin geleneksel olarak halletmektedirler, bu nedenle sınırlı sayıda dava vardır. Üstelik kanunlar bir sisteme bağlı değildir, ve uygulanabilir kanunların spesifik bir işlemin vergisel uygulaması belirlenmeden önce çok dikkatli hazırlık safhası geçirmesi gerekir. Nüfusun yaşlanması, doğum oranının düşmesi ve globalizasyondaki hızlı gelişmeler nedeniyle teşvik edilen yapısal bir reform canlı bir Japon ekonomik toplumuna ulaşmada acil bir hedef olmuştur. 21. yüzyıla yenilenmiş bir toplum olarak girebilmek için de vergi sistemini yeniden düzenlemeye tabi tutmak gerekli ve önemli olmuştur. Bu nedenle, vergi komisyonu 2003 yılı Haziran ayında “Amaçlanan Bir Vergi Sisteminin Oluşumuna Dayanan Politika Rehberi” (“Politika Rehberi”) yayınlamıştır. Bu rehber Japon ekonomisi ve toplumunun sürdürülebilir büyümesini orta dönemli bir perspektiften uzun dönemli bir perspektife taşımak için arzulanan bir vergi sisteminin genel çerçevesini çizmektedir. Bu genel çerçevede yapılan vergi reformları ile çeşitli vergilerde düzenlemelere gidilmiş, kişisel indirimlerin basitleştirilmesine, vergilerin modernize edilerek en verimli hale getirilmelerine, vergisel indirimlerin arttırılmasına ve yatırımların teşvik edilmesine çalışılmıştır. Reform ile tüketim vergisinin güvenilirlik ve saydamlığı nın arttırılması, veraset ve intikal vergilerinin birleştirilmesi, kurumların yaptıkları faaliyetlerin ölçüsüne göre vergilendirilmeleri, mali değerler üzerindeki vergilendirmenin tekrar gözden geçirilmesi, çevresel sorunların çözümüne vergisel önlemlerle çözüm getirme amaçlanmıştır. Japonya bu rehberin yayınlanmasından itibaren vergi sisteminde aşağıdaki hedeflere ulaşmaya çalışan bir çaba içine girmiştir. Yaşlanan nüfus, düşen doğum oranı karşısında; - Gelecek için güven veren ve gelir, servet ve harcama arasında denge sağlayan bir vergi sistemi oluşturmak, - Kapsamında tüm kesimlerin dikkate alındığı bir vergi sistemi oluşturmak, örneğin doğum oranının düşmesinin sayıları artan yaşlı kesimin de dikkate alındığı bir vergi sisteminin varlığını gerekli kılması, - Kişilere ve kurumlara canlılık veren bir vergi sistemi oluşturmak ve bunun için bireyin çalışmasına ya da kurumun şekil değiştirmesine yol açmayan “basit”, “tarafsız” ve “açık” bir vergi sistemine yönelmek, gibi amaçlar öncelikli olmuştur. Japonya’da yapısal sorunların üstesinden gelmek, reel ve sürdürülebilir bir büyümeyi sağlamak için vergi sisteminin ülkedeki yatırımcıların işlerini kolaylaştırıcı, yabancı yatırımcılar için cazip ve çekici bir ortam oluşturucu şekilde yapılanması ve işlemesi önemlidir. Ayrıca ülkedeki nüfusun yaş yapısı ve devlet borç profili de vergilendirmenin sağlam ve istikrarlı temeller üzerine oturtulmasını gerekli kılmaktadır. Aşağıda Japon Vergi Sisteminde yer alan vergiler, bunların işleyişi, oranları, diğer ülke vergilerine göre oransal farklılıkları gibi hususları ortaya konmaya çalışılmıştır.